2017年9月8日，首都儿科研究所通过中国出生缺陷干预救助基金会在全国范围内开展出生缺陷干预救助“示范基地”和 “救助基地”的审核，将与基金会共同建立出生缺陷预防、治疗、康复、救助为一体的干预救助基地网络。

　　“示范基地”和 “救助基地”是国家卫计委妇幼司和中国出生缺陷干预救助基金会联合开展“先天性结构畸形救助项目”内容之一，旨在减少先天性结构畸形所致残疾，提高人口素质，救治出生缺陷。此前在2016年12月30日，经过首都儿科研究所多方努力，成为该项目的北京定点医疗机构。

　　2017年5月25日， “先天性结构畸形救助项目”正式在北京市启动。通过救助项目，可以为就诊于首都儿科研究所、并在此接受诊治和康复的小于18周岁的6类先天性结构畸形贫困患儿提供救助，病种覆盖首都儿科研究所6个外科科室72个病种。

　　项目启动后，首都儿科研究所对2016年1月1日之后符合救助条件的患儿按流程开展救助。截止2017年9月20日已为81名患儿提出申请，其中75名患儿通过初审，20名患儿通过项目管理机构的复审，经过基金会复核后将发放救助款项。今后还会优化流程，加快复审。

　　2017年9月12日国家卫计委联合中国出生缺陷干预救助基金会举办“出生缺陷宣传日”宣传活动，并授予首都儿科研究所出生缺陷“示范基地”及“救助基地”称号。今后将会承接基金会向国家相关部门申报的更多公益项目，并配合基金会开展出生缺陷干预救助公益活动，指导区域内的救助基地形成服务网络。